| 1. Identificação | |
| Tipo de Referência | Artigo em Revista Científica (Journal Article) |
| Site | mtc-m21b.sid.inpe.br |
| Código do Detentor | isadg {BR SPINPE} ibi 8JMKD3MGPCW/3DT298S |
| Identificador | 8JMKD3MGP5W34M/3FA44RC |
| Repositório | sid.inpe.br/mtc-m21b/2013/11.26.16.47.43 (acesso restrito) |
| Última Atualização | 2014:02.10.12.39.49 (UTC) administrator |
| Repositório de Metadados | sid.inpe.br/mtc-m21b/2013/11.26.16.47.44 |
| Última Atualização dos Metadados | 2018:06.04.03.14.08 (UTC) administrator |
| DOI | 10.1016/j.gene.2013.06.060 |
| ISSN | 0378-1119 |
| Rótulo | scopus 2013-11 |
| Chave de Citação | GerhardtTASEASR:2013:TrEnAn |
| Título | Triplet entropy analysis of hemagglutinin and neuraminidase sequences measures influenza virus phylodynamics  |
| Ano | 2013 |
| Mês | Oct. |
| Data de Acesso | 18 maio 2024 |
| Tipo de Trabalho | journal article |
| Tipo Secundário | PRE PI |
| Número de Arquivos | 1 |
| Tamanho | 423 KiB |
| 2. Contextualização | |
| Autor | 1 Gerhardt, Günther J. L. 2 Takeda, Agnes A. S. 3 Andrighetti, Tahila 4 Sartor, Ivaine T. S. 5 Echeverrigaray, Sergio L. 6 Avila e Silva, Scheila de 7 Santos, Laurita dos 8 Rybarczyk-Filho, José L. |
| Grupo | 1 2 3 4 5 6 7 LAC-CTE-INPE-MCTI-GOV-BR |
| Afiliação | 1 Departamento de Física e Química da Universidade de Caxias do Sul, Rua Francisco Getulio Vargas 1130, 95001-970 Caxias do Sul, RS, Brazil 2 Department of Physics and Biophysics, Institute of Biosciences, Univ Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Distrito de Rubião Junior S/N, 18618-970 Botucatu, SP, Brazil 3 Department of Physics and Biophysics, Institute of Biosciences, Univ Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Distrito de Rubião Junior S/N, 18618-970 Botucatu, SP, Brazil 4 Instituto de Biotecnologia da Universidade de Caxias do Sul, Rua Francisco Getulio Vargas 1130, 95001-970 Caxias do Sul, RS, Brazil 5 Instituto de Biotecnologia da Universidade de Caxias do Sul, Rua Francisco Getulio Vargas 1130, 95001-970 Caxias do Sul, RS, Brazil 6 Instituto de Biotecnologia da Universidade de Caxias do Sul, Rua Francisco Getulio Vargas 1130, 95001-970 Caxias do Sul, RS, Brazil 7 Instituto Nacional de Pesquisas Espaciais (INPE) 8 Department of Physics and Biophysics, Institute of Biosciences, Univ Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Distrito de Rubião Junior S/N, 18618-970 Botucatu, SP, Brazil |
| Endereço de e-Mail do Autor | 1 gunther_lew@yahoo.com.br |
| Endereço de e-Mail | marcelo.pazos@inpe.br |
| Revista | Gene |
| Volume | 528 |
| Número | 2 |
| Páginas | 277-281 |
| Nota Secundária | A2 A2 A2 B1 B1 B1 B1 B1 B1 B1 B1 B1 B2 B2 |
| Histórico (UTC) | 2018-06-04 03:14:08 :: administrator -> marcelo.pazos@inpe.br :: 2013 |
| 3. Conteúdo e estrutura | |
| É a matriz ou uma cópia? | é a matriz |
| Estágio do Conteúdo | concluido |
| Transferível | 1 |
| Tipo do Conteúdo | External Contribution |
| Tipo de Versão | publisher |
| Palavras-Chave | nucleotide virus hemagglutinin virus sialidase article DNA base composition entropy genetic organization genetic variability Influenza virus Influenza virus A H1N1 Influenza virus A H3N2 molecular phylogeny nonhuman pandemic influenza priority journal sequence analysis species comparison strain difference triplet entropy analysis viral genetics Orthomyxoviridae |
| Resumo | The influenza virus has been a challenge to science due to its ability to withstand new environmental conditions. Taking into account the development of virus sequence databases, computational approaches can be helpful to understand virus behavior over time. Furthermore, they can suggest new directions to deal with influenza. This work presents triplet entropy analysis as a potential phylodynamic tool to quantify nucleotide organization of viral sequences. The application of this measure to segments of hemagglutinin (HA) and neuraminidase (NA) of H1N1 and H3N2 virus subtypes has shown some variability effects along timeline, inferring about virus evolution. Sequences were divided by year and compared for virus subtype (H1N1 and H3N2). The nonparametric Mann-Whitney test was used for comparison between groups. Results show that differentiation in entropy precedes differentiation in GC content for both groups. Considering the HA fragment, both triplet entropy as well as GC concentration show intersection in 2009, year of the recent pandemic. Some conclusions about possible flu evolutionary lines were drawn. |
| Área | COMP |
| Arranjo | urlib.net > BDMCI > Fonds > Produção anterior à 2021 > LABAC > Triplet entropy analysis... |
| Conteúdo da Pasta doc | acessar |
| Conteúdo da Pasta source | não têm arquivos |
| Conteúdo da Pasta agreement | não têm arquivos |
| 4. Condições de acesso e uso | |
| Idioma | en |
| Arquivo Alvo | 1-s2.0-S0378111913008287-main.pdf |
| Grupo de Usuários | administrator marcelo.pazos@inpe.br |
| Grupo de Leitores | administrator marcelo.pazos@inpe.br |
| Visibilidade | shown |
| Permissão de Leitura | deny from all and allow from 150.163 |
| Permissão de Atualização | não transferida |
| 5. Fontes relacionadas | |
| Repositório Espelho | iconet.com.br/banon/2006/11.26.21.31 |
| Unidades Imediatamente Superiores | 8JMKD3MGPCW/3ESGTTP |
| Divulgação | WEBSCI; PORTALCAPES; SCOPUS. |
| Acervo Hospedeiro | sid.inpe.br/mtc-m21b/2013/09.26.14.25.20 |
| 6. Notas | |
| Campos Vazios | alternatejournal archivingpolicy archivist callnumber copyholder copyright creatorhistory descriptionlevel format isbn lineage mark nextedition notes orcid parameterlist parentrepositories previousedition previouslowerunit progress project resumeid rightsholder schedulinginformation secondarydate secondarykey session shorttitle sponsor subject tertiarymark tertiarytype url |
| 7. Controle da descrição | |
| e-Mail (login) | marcelo.pazos@inpe.br |
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